基因组数据包含线粒体基因组、叶绿体基因组以及由“万种鱼基因组计划”和“万种原生生物基因组计划”产出的全基因组测序数据。基因组作为物种的“超级条形码”，其解析能力远高于DNA条形码。同时基因组数据可以提供物种遗传信息，为研究生物多样性和功能多样性提供参考。